הקצנת המנטליות, שינויים פוליטיים וחברתיים ומצבי משבר הביאו לכך שהדו-קיום השלו הפך למצב של אלימות קיצונית. החל מהמאה ה-14, הקהילות היהודיות הותקפו, הודרו והואשמו לעתים קרובות בביצוע פשעים וחילול הקודש. בסוף המאה ה-15, צו ההתבוללות ליהודים הוביל לעזיבתן של הרבה משפחות.