שרידי המקווה, בה השתמשה הקהילה היהודית של ג'ירונה בין 1435 ו-1492 נמצאים בקומה השנייה, בצד השני של החצר. איתורו התאפשר הודות לחפירות שהתקיימו בפברואר 2014 מסביב לחלל של בור המים הישן. מדובר במקווה בממדים קטנים שאגר מי גשם דרך תעלות שנתגלו במהלך החפירות.