El museu explica la cultura ibèrica a la zona nord-est de Catalunya a través de les excavacions dels dos assentaments ibèrics que componen el conjunt arqueològic d’Ullastret, el puig de Sant Andreu i l’Illa d’en Reixac, i de la necròpolis del puig de Serra a Serra de Daró.
L’exposició dels objectes i troballes d’aquests jaciments s’organitza en dues tipologies de vitrines-plafó: les que donen informacions de caràcter general sobre cronologia, paleoentorn, formació i característiques de la cultura ibèrica; i les vitrines-plafó on s’expliquen temes monogràfics com ara el comerç, les creences religioses, els rituals funeraris, l’urbanisme o l’economia.