Dans les salles 5 et 6, nous pouvons contempler les sculptures du maître Bartomeu, qui marquent la transition du roman vers le gothique. L'ensemble constitué par le Calvari (Calvaire), datant du XIIIe et provenant de la cathédrale de Gérone, et le tympan de l'Hospital de Clergues de Gérone, tous deux restaurés récemment, illustrent parfaitement cette transition. Au XIVe siècle une sculpture plus délicate fait sa place, nettement influencée par l'art gothique international. Les œuvres du maître Aloi ou de Jaume Cascalls en sont des exemples. L'une des pièces les plus remarquables se trouve en salle 7 : les établis de vitrailliste qui ont servi à réaliser les vitraux de la zone de l'abside de la cathédrale de Gérone. Ils constituent l'un des derniers échantillons conservés en Europe de matériaux utilisés pour le métier de vitrailliste.
Le majestueux Salon du Trône, en salle 8, rassemble quelques retables très intéressants du XVe siècle : le Sant Miquel de Cruïlles de Lluís Borrassà, le Mare de Déu de la Llet de Sant Esteve de Canapost, celui de Sant Miquel de Castelló d’Empúries ainsi que le Retaule de Sant Pere de Púbol. Ils sont l'œuvre de peintres qui ont travaillé en terre géronaise aux alentours des XIVe et XVe siècles.