Les Romains arrivent à Empúries en 218 av. J.-C., pendant la Deuxième Guerre punique, qui les oppose au légendaire Hannibal, chef des troupes militaires carthaginoises. En plein conflit, alertés par les Grecs, les Romains débarquent leurs légions dans le port de la ville grecque d’Emporion pour entamer un périple péninsulaire qui va leur permettre de neutraliser l’arrière-garde de l’armée carthaginoise. Cet épisode, qui va faire d’Empúries la porte d’entrée des Romains dans la péninsule, marque aussi le début de la conquête et de la romanisation du territoire péninsulaire, connu sous le nom d’Hispanie.
En 195 av. J.-C., les Romains retournent à Empúries et y installent un camp militaire pour étouffer les incessantes révoltes indigetes qui s’élèvent contre l’occupation romaine. Après la pacification du territoire, les terres sont offertes en récompense aux soldats vétérans de Jules César, qui fondent alors le municipe romain d’Emporiae. Celle-ci, dont la période de splendeur se situe sous l’Empire, annexe la vieille ville grecque d’Emporion. Elle sera laissée à l’abandon au IIIe siècle ap. J.-C. De nos jours, la ville a été en partie mise au jour (les fouilles concernent près de 20 % de sa surface totale). On peut visiter son forum (centre institutionnel), ses thermes romains, quelques domus (maisons des classes aisées) et l’amphithéâtre.