El Museu d’Història dels Jueus té com a objectiu preservar i difondre la història de les comunitats jueves de Catalunya, que al llarg de tota l'edat mitjana varen formar part i varen contribuir decisivament a la trajectòria històrica i al desenvolupament cultural i científic del país. Les explicacions del recorregut museològic s’il·lustren amb exemples procedents de la història de la Girona jueva. Són exemples documentals, arqueològics i iconogràfics que ofereixen una explicació genèrica de les formes de vida jueva a la Catalunya medieval.